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凝胶净化柱的好坏直接关系到样品净化的好坏，众多标准方法中规定使用柱填料为Bio-beads S-X3凝胶，粒径为200-400目，根据样品基质不同，填充溶剂分为二氯甲烷和1:1乙酸乙酯：环己烷等溶剂。
参考US EPA SW-845（方法3640A）净化能力验证，凝胶净化柱需要70g Bio-beads S-X3凝胶填料填充，同时分离校准溶液玉米油、邻苯二甲酸酯、甲氧滴滴涕、二萘嵌苯及硫，其色谱峰分离度应为85%以上。
高分辨不锈钢凝胶净化柱，采用中压一次成型技术进行装填。该种净化柱能解决以上传统玻璃柱带来的诸多问题，具有净化速度快，柱效高，柱间平行性好，较小规格即可满足实验需求，极大的节省试验时间和有机溶剂等优点。采用此种净化柱，分离EPA校准溶液仅需22分钟，大大缩短了样品处理时间，节省溶剂。在食品检测、农产品检测、粮油及环境检测等应用领域显现突出优势。
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